Paano buksan, i-edit, at i-convert ang mga PDB file
Ang isang file na may extension ng PDB file ay malamang na isang file na nilikha sa format ng Program Database na ginagamit upang i-hold ang pag-debug ng impormasyon tungkol sa isang programa o module, tulad ng isang DLL o EXE file. Ang mga ito ay minsan tinatawag na simbolo ng mga file.
Ang PDB file ay naglilista ng iba't ibang mga bahagi at mga pahayag sa isang source code sa huling pinagsama-samang produkto nito, na maaaring gamitin ng debugger upang mahanap ang source file at ang lokasyon sa mga maipapatupad kung saan dapat itong itigil ang proseso ng pag-debug.
Ang ilang mga PDB file ay maaaring maging sa format ng file ng Protein Data Bank. Ang mga PDB file na ito ay plain text file na nag-iimbak ng mga coordinate tungkol sa mga istruktura ng protina.
Ang iba pang mga PDB file ay marahil ay nilikha sa Palm Database o PalmDOC na format ng file at ginagamit sa PalmOS mobile operating system . Ang ilang mga file sa format na ito ay gumagamit ng extension ng .PRC file sa halip.
Paano Magbubukas ng isang PDB File
Ang iba't ibang mga programa ay gumagamit ng kanilang sariling PDB file upang mag-imbak ng data sa ilang uri ng nakabalangkas na format ng database, kaya ang bawat aplikasyon ay ginagamit upang buksan ang sarili nitong uri ng PDB file. Ang mga Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio, at Pegasus ay ilan lamang sa mga halimbawa ng mga programa na maaaring gumamit ng isang PDB file bilang isang database file. Maaaring gumana ang Radare at PDBparse para sa pagbubukas ng mga PDB file.
Ang ilang mga PDB file ay naka-imbak bilang plain text, tulad ng Geneious 'Program Debug Database file, at ganap na tao-nababasa kung binuksan sa isang text editor. Maaari mong buksan ang ganitong uri ng PDB file sa anumang programa na maaaring magbasa ng mga dokumento ng teksto, tulad ng built-in na Notepad program sa Windows. Kasama sa iba pang mga viewer at editor ng PDB file ang Notepad ++ at Bracket.
Ang iba pang mga file ng PDB database ay hindi mga dokumento ng teksto at kapaki-pakinabang lamang kapag binuksan gamit ang programa na nilalayon nito. Halimbawa, kung ang iyong PDB file ay may kaugnayan sa ilang paraan upang magmadali, pagkatapos ay subukan gamit ang software na iyon upang tingnan o i-edit ang PDB file. Inaasahan ng Visual Studio na makita ang isang PDB file sa parehong folder bilang DLL o EXE file.
Maaari mong tingnan at i-edit ang mga file ng PDB na mga file ng Protein Data Bank, sa Windows, Linux, at macOS sa Avogadro. Maaari ring buksan ng Jmol, RasMol, QuickPDB, at USCF Chimera ang isang PDB file. Dahil ang mga file na ito ay plain text, maaari mo ring buksan ang PDB file sa isang editor ng teksto masyadong.
Dapat na mabuksan ng Palm Desktop ang mga file ng PDB na nasa format ng file ng Palm Database ngunit maaari mo munang palitan ang pangalan nito upang magkaroon ng extension ng .PRC file para sa programang iyon upang makilala ito. Upang magbukas ng PalmDOC PDB file, subukan ang STDU Viewer.
Paano Mag-convert ng isang PDB File
Ang mga file ng Database ng Programa ay malamang na hindi ma-convert sa ibang format ng file, hindi bababa sa hindi sa isang regular na file converter tool . Sa halip, kung may anumang tool na makakapag-convert ng ganitong uri ng PDB file, ito ay magiging parehong programa na maaaring magbukas nito.
Halimbawa, kung kailangan mong i-convert ang iyong PDB database file mula sa Quicken, subukang gamitin ang programang iyon upang gawin ito. Ang ganitong uri ng conversion, gayunpaman, ay marahil hindi lamang ng maliit na paggamit ngunit hindi rin sinusuportahan sa mga application ng database na ito (ibig sabihin, malamang na hindi mo kailangang i-convert ang ganitong uri ng PDB file sa anumang iba pang format).
Maaaring i-convert ang mga file ng Protein Data Bank sa ibang mga format na may MeshLab. Upang gawin ito, kailangan mo munang i-convert ang PDB file sa WRL sa PyMOL mula sa File> Save Image As> VRML menu, at pagkatapos ay i-import ang WRL file sa MeshLab at gamitin ang File> Export Mesh As menu upang ganap na i-convert ang PDB file sa STL o ibang format ng file.
Kung hindi mo kailangan ang modelo na maging kulay, maaari mong i-export ang PDB file nang direkta sa STL sa USCF Chimera (ang link sa pag-download ay nasa itaas). Kung hindi man, maaari mong gamitin ang parehong paraan tulad ng sa itaas (na may MeshLab) upang i-convert ang PDB sa WRL sa USCF Chimera at pagkatapos ay i-export ang WRL file sa STL sa MeshLab.
Upang ma-convert ang PDB sa PDF o EPUB , kung mayroon kang isang PalmDOC file, posible ang ilang mga paraan ngunit ang pinakamadaling ay marahil ay gumamit ng online na PDB converter tulad ng Zamzar . Maaari mong i-upload ang iyong PDB file sa website na iyon upang magkaroon ng opsyon na i-convert ito sa mga format pati na rin sa AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT, at iba pang mga format ng file ng eBook.
Upang i-convert ang PDB file sa format ng FASTA ay maaaring gawin sa online na Meiler Lab na PDB sa FASTA converter.
Posible ring i-convert ang PDB sa CIF (Crystallographic Information format) online gamit ang PDBx / mmCIF.
Advanced Reading sa PDB Files
Maaari kang magbasa ng higit pa tungkol sa mga file ng Program Database mula sa Microsoft, GitHub, at Wintellect.
Mayroong higit pa upang malaman ang tungkol sa mga file ng Protina Data Bank masyadong; tingnan ang Worldwide Protein Data Bank at RCSB PDB.
Hindi Pa Ba Pagbubukas ang Iyong File?
Ang mga PDB file na hindi binubuksan sa alinman sa mga tool mula sa itaas, marahil ay hindi talaga mga PDB file. Ano ang maaaring mangyari ay na hindi mo nabasa ang extension ng file; ang ilang mga format ng file ay gumagamit ng isang suffix na malapit na nakatago sa "PDB" kapag sila ay talagang walang kaugnayan at hindi gumagana ang parehong.
Halimbawa, ang isang PDF file ay isang dokumento na file ngunit ang karamihan sa mga program mula sa itaas ay hindi maaring tama ang teksto at / o mga imahe kung susubukan mong buksan ang isa sa mga programang ito ng software. Ang parehong ay totoo para sa iba pang mga file na may parehong spelled extension ng file, tulad ng PD, PDE, PDC, at PDO file.
Ang PBD ay isa pang kabilang sa programa ng EaseUS Todo Backup at samakatuwid ay kapaki-pakinabang lamang kapag binuksan gamit ang software na iyon.
Kung wala kang isang PDB file, pagkatapos ay saliksikin ang extension ng file na mayroon ang iyong file upang makita mo ang naaangkop na programa na nagbubukas o nag-convert nito.